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primer设计引物网站

发布时间:2020-08-28 22:29:29

1、primer premier 6怎样设计引物

引物设计有3 条基本原则:首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构,再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA 聚合反应(即错配)。引物设计应注意如下要点: 1 引物的长度一般为15-30 bp,常用的是18-2

2、如何primer5设计引物

一句话两句话的也说不清楚,你下载个primer5的使用说明不就行了?
http://wenku.网络.com/view/292349240722192e4536f63d.html
http://wenku.网络.com/view/b0bcec4733687e21af45a9f6.html?from=rec&pos=0&weight=21&lastweight=4&count=5
http://wenku.网络.com/view/1f66d3fe700abb68a982fb62.html?from=rec&pos=3&weight=912&lastweight=837&count=5

3、使用primer premier5.0设计引物

点文件,选新建DNA序列(File——New——DNA Seqence)然后把要设计引物的序列复制进去就行了(如果你要是愿意也可以一个一个碱基的打进去),然后点Primer进入到引物设计界面,进去后选点 Search 设置相应相应的条件,如:你要设计PCR扩增还是测序引物,是正向、反向还是双向,在片段中的那个位置设计及引物的长度等等,设置好后一路OK点下去就行了,然后就会有引物出来供你选择了。

哈哈不过具体的步骤1L那个网址好像已经给出了,不过在设计引物时LZ还要注意些条件,如TM值和GC一类的,还有引物长度等等^_^

反正我一般设计引物的时候TM和GC都控制在50-60之间,长度一般18或19个碱基(555合成的时候按碱基收费呀555),错配和发卡都没有,不过引物二聚体有的话问题倒是不大(反正我设计出来有二聚体的引物基本都OK)然后就是最好不要有4个或以上连续的碱基,再有就是不要在重复序列里设计引物。

只要注意以上这些的话设计出的引物那里测序或扩增都OK

呵呵希望对LZ有所帮助

4、如何用PRIMER5.0设计引物

进入软件,genetank窗口file---new----DNA sequence进入序列输入版块。然后control+v输入序列,如不改变序列,选择AS菜单。

然后进入primer引物设计。进入search,点OK。系统自动生成引物。
选你需要的就可以了。(有评分)。如要克隆基因,则在primer菜单下手动设计。

5、如何使用primer5.0设计引物

首先打开NCBI,将查找范围选定为Nucleotide,输入关键词,找到目的序列

首先肯定是要有保存好的基因序列,这里我是从NCBI上保存的DNA序列

然后,打开Primer应用程序,单击Activate Proct进行激活。打开新的GenTank核酸窗口

打开保存的DNA序列

点击Primer,查找引物

然后点击Search,参考参数寻找合适的引物

6、关于使用primer 5.0设计PCR引物,哪位哥帮帮我啊,着急啊...

1、primer 5.0的各类参数是可以自己设置的,变化参数结果就会不一样。就引物设计而言primer 5.0优于oligo 6.0,一般的方法是用primer 5.0设计,oligo 6.0来检测;
2、可以自己自己动手修改,完全没有问题,我自己试过。一般引物允许20%的不一致,但是在3端最好不要自己修改,3端也不要有发卡结构

7、如何如何使用primer primer设计引物

首先得下载安装一个primer5 的软件,网上百度搜索后即可下载获得

点击File下拉菜单,选择New,然后选择DNA Sequence

从word文件中copy目标序列,然后control+V到primer5的文本框中,选择As is,点击OK。

设计引物前得进行酶切位点分析,所以要点击Enzyme按钮,选择Add添加目标酶,然后点击OK进行分析检测

完成上面之后,我们开始点击primer选项设计引物

点击S/A,分别代表设计上游/下游引物,这里我们就点击S为例来设计上游引物

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设计好之后往往需要根据作者的需要进行编辑,这时就点击Edit primers,然后出现以下界面,作者就可以进行编辑修改了,这样就基本完成获得你所需要的引物了

8、primer primer5怎么设计引物

首先打开软件
左上角来操作
file——new——dna sequence
这一项可以把你复制的序列粘贴进去
当然,你也可以选择另一个
file——open——dna sequence
去open一个新的文件。在接下来的界面里
复制你的序列,于是就将序列导入了点击search
进入下图界面开始设计引物
在此图中有6个部分,红色数字标示
1区,包括三部分,可以选择设计pcr引物,测序引物和杂交探针
2区,搜寻模式,包括正链,反链等,我们一般选最后一项pairs,出来一组引物
3区,引物的范围,上游引物所在范围,下游引物所在范围
4区,pcr 长度,根据需要设置
5区,引物长度,这个是调整的重点,前面是长度,后面是±
6区,选择模式,一般选auto,也可以手动下面是一个设计
我选择了
正链位于1-400内
负链位于500-910内
产物长度100-600
引物长度为20±1bp

输入后,出现下图界面
共有1000多条引物
点击ok

9、怎么用primer-blast设计引物

Primer-BLAST,在线设计用于聚合酶链反应(PCR)的特异性寡核苷酸引物。
这个工具整合了目前流行的Primer3,再加上NCBI的
Blast进行引物特异性的验证。Primer-BLAST免除了用另一个站点或工具设计引物的步骤,设计好的引物程序直接用Blast进

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