1、LAMP引物怎么设计?
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2、lamp的使用详情
目前国内基因诊断常采用PCR方法,涉及到PCR仪,该仪器价格国产和进口价格不一,便宜的2~3万也能买到,贵的20多万。条件比较好的实验室和国家机构也有尝试荧光定量PCR方法的,该方法技术含量高,必须使用荧光定量PCR仪,价格在20~70万不等。
使用环介导等温扩增技术的产品在临床诊断中是不需要特殊仪器的,但临床使用的成品试剂盒在研发过程中由于涉及引物的选择,引物浓度的调整,及反应温度和时间的优化,需要用一种量化的方式去帮助研究者分析选择数据,因此我们推荐使用荣研公司的专利产品LA-320C或LA-500实时浊度仪。
环介导等温扩增法,英文名称为loop-mediatedisothermal amplification,,是一种新型的核酸扩增方法,其特点是针对靶基因的6个区域设计4种特异引物,在链置换DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)的作用下,60--65℃恒温扩增,15-60分钟左右即可实现10^9~10^10倍的核酸扩增,具有操作简单、特异性强、产物易检测等特点。在DNA合成时,从脱氧核糖核酸三磷酸底物(dNTPs)中析出的焦磷酸离子与反应溶液中的镁离子反应,产生大量焦磷酸镁沉淀,呈现白色。因此,可以把浑浊度作为反应的指标,只用肉眼观察白色浑浊沉淀,就能鉴定扩增与否,而不需要繁琐的电泳和紫外观察。由于环介导等温扩增反应不需要PCR仪和昂贵的试剂,有着广泛的应用前景。
3、请教一些LAMP网站建设的问题
Apache是LAMP架构最核心的Web Server,开源、稳定、模块丰富是Apache的优势。但Apache的缺点是有些臃肿,内存和CPU开销大,性能上有损耗,不如一些轻量级的Web服务器(例如nginx)高效,轻量级的Web服务器对于静态文件的响应能力来说远高于Apache服务器。
Apache做为Web Server是负载PHP的最佳选择,如果流量很大的话,可以采用nginx来负载非PHP的Web请求。nginx是一个高性能的HTTP和反向代理服务器,Nginx以它的稳定性、丰富的功能集、示例配置文件和低系统资源的消耗而闻名。Nginx不支持PHP和CGI等动态语言,但支持负载均衡和容错,可和Apache配合使用,是轻量级的HTTP服务器的首选。
Web服务器的缓存也有多种方案,Apache提供了自己的缓存模块,也可以使用外加的Squid模块进行缓存,这两种方式均可以有效的提高Apache的访问响应能力。Squid Cache是一个Web缓存服务器,支持高效的缓存,可以作为网页服务器的前置cache服务器缓存相关请求来提高Web服务器的速度,把Squid放在Apache的前端来缓存Web服务器生成的动态内容,而Web应用程序只需要适当地设置页面实效时间即可。如访问量巨大则可考虑使用memcache作为分布式缓存。
PHP的加速使用eAccelerator加速器,eAccelerator是一个自由开放源码PHP加速器,优化和动态内容缓存,提高了性能PHP脚本的缓存性能,使得PHP脚本在编译的状态下,对服务器的开销几乎完全消除。它还有对脚本起优化作用,以加快其执行效率。使PHP程序代码执效率能提高1-10倍。
具体的解决方案有以下几种:
1、squid + Apache + PHP + eAccelerator
使用Apache负载PHP,使用squid进行缓存,html或图片的请求可以直接由squid返回给用户。很多大型网站都采用这种架构。
2、nginx/Apache + PHP(fastcgi) + eAccelerator
使用nginx或Apache负载PHP,PHP使用fastcgi方式运行,效率较高。
3、nginx + Apache + PHP + eAccelerator
此方案综合了nginx和Apache的优点,使用Apache负载PHP,nginx负责解析其他Web请求,使用nginx的rewrite模块,Apache端口不对外开放。
数据库
开源的数据库中,MySQL在性能、稳定性和功能上是首选,可以达到百万级别的数据存储,网站初期可以将MySQL和Web服务器放在一起,但是当访问量达到一定规模后,应该将MySQL数据库从Web Server上独立出来,在单独的服务器上运行,同时保持Web Server和MySQL服务器的稳定连接。
当数据库访问量达到更大的级别,可以考虑使用MySQL Cluster等数据库集群或者库表散列等解决方案。
总的来说,LAMP架构的网站性能会远远优于Windows IIS + ASP + Access(例如月光博客)这样的网站,可以负载的访问量也非常大,国内的大量个人网站如果想要支撑大访问量,采用LAMP架构是一个不错的方案。
综上所述,基于LAMP架构设计具有成本低廉、部署灵活、快速开发、安全稳定等特点,是Web网络应用和环境的优秀组合。
4、在线Primer3引物设计怎么用?
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5、怎样在线做PCR引物设计
百度输入primer3,应该有2-4个网站可以设计引物,直接把序列放进去就可以了
6、如何如何使用primer primer设计引物
首先得下载安装一个primer5 的软件,网上百度搜索后即可下载获得
点击File下拉菜单,选择New,然后选择DNA Sequence
从word文件中copy目标序列,然后control+V到primer5的文本框中,选择As is,点击OK。
设计引物前得进行酶切位点分析,所以要点击Enzyme按钮,选择Add添加目标酶,然后点击OK进行分析检测
完成上面之后,我们开始点击primer选项设计引物
点击S/A,分别代表设计上游/下游引物,这里我们就点击S为例来设计上游引物
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设计好之后往往需要根据作者的需要进行编辑,这时就点击Edit primers,然后出现以下界面,作者就可以进行编辑修改了,这样就基本完成获得你所需要的引物了
7、ion ampliseq designer 引物设计怎么用
Beacon Designer是一款比较强大的引物设计兼检索和Blast功能的,不仅可以设计一般的引物,回还可以进答行普通RT-PCR,Taqman Probe,Beacon Probe等多种引物的设计,操作是傻瓜式的,设计引物要求和PP7.0等无异,每款的help里都有的详细应用,希望对你有用!
8、师兄师姐们,有没有好的LAMP引物设计软件或网站?
primerexplore.jp/e/这个网站可以